日文中的「源泉徵收稅」，類似於台灣的「所得稅代扣」，凡非日本居住者在日本持有租賃物件時，在以下兩種情況之下，依日本稅務法令規定需做源泉徵收。

1. 當承租方是法人公司

2. 個人契約但做為事務所與店舖等用途

不動產收入的源泉徵收稅率為20.42%，自租金中先行扣繳，每年申報所得稅時，可針對應繳所得稅後的差額進行補退，實質的年度租金總收入是相同的。

由於日本稅務署只將溢繳的款項退還至居住者帳戶，若在日本國內無居住者帳戶，便無法辦理退稅，因此一定要委託在日持有居住資格的納稅管理人或稅理士協助處理。